明嘉靖年间属南社乡十六都和十七都；清沿之，有塘头、沙园、南爿、柏树、郭巷、团前、直落等25庄（清嘉庆《瑞安县志》）。
1931年分置林垟镇、阁巷镇、沙园乡、蔡桥乡，属第二区；1935年合置林阁镇、沙平乡；1946年合置林阁镇，属仙降区；1949年8月析置阁巷乡、林垟乡，属仙降区；1953年林垟撤乡建镇；1956年阁巷与林垟合置海滨乡；1958年9月改称阁巷、林垟生产大队（1959年改为阁巷管理区、林垟管理区），属海滨（仙降）公社；1961年9月改建阁巷、林垟人民公社，属仙降区；1984年4月复置阁巷乡、林垟乡；1985年林垟撤乡建镇；1992年撤仙降区；1994年阁巷撤乡建镇；2000年6月林垟、阁巷镇并入飞云镇；2011年4月以飞云镇的原林垟、阁巷辖区20个村合置南滨街道。
地处飞云江近海处南岸、平原水网地带，地势低，海拔3.5—4米。
三国时就是吴国橫屿船屯停泊船只的一大港湾，后淤成陆地，20多条河流以林垟为中心如蛛网状向四周辐射，有下塘河及分支龙船河、车头河、直垟河等注入飞云江，多条河流与瑞平塘河相通。
河道交错，河阔水深，素以河多、桥多、船多闻名，有“浙南威尼斯”之美誉。
江岸海岸线长，海涂广阔。