清康熙、光绪《於潜县志》载有闽里、闽坞庄地名。
南宋咸淳间（1265～1274）属於潜县丰国乡，明初属丰国前乡，清嘉庆十七年（1812）闽坞、凌家庄属丰国前乡。
民国初属藻溪乡，民国21年（1932）闽川庄属长槐乡，民国24年（1935）属藻溪乡，民国36年（1947）属丰前乡至解放。
1950年为藻溪乡董家村，1956年为董家高级社，1958年为昌化县天目公社藻溪管理区凌家、闽坞生产队，1961年为临安县藻溪公社闽坞、凌家生产大队，1984年为藻溪乡闽坞、凌家、百亩村，1989年属藻溪镇。
2007年村规模调整，三村合并为闽坞村，辖5个自然村。
2011年1月为天目山镇闽坞村。
获评杭州市级文明村、2010年临安市“绿色家园、富丽山村”建设精品村、2011年杭州市美丽乡村建设精品村。