南宋咸淳年间（1265～1274）属临安县衣锦南乡。
明代称庆仙乡。
清乾隆二十四年（1759）属庆仙二图、南北二图。
至清宣统二年（1910）图名依旧。
民国初期称庆凤乡。
1928实行村里制，以区管村，属庆凤区。
1935称甘樟乡。
1941称横溪乡。
1945撤区并乡，称玲珑、锦南乡至解放。
1950年7月划乡建政，建上礼、甘山乡，属玲珑区。
1956年10月两乡合并为上甘乡。
1958年10月由上甘、青贤、上东、横溪乡和城关镇合并建立临安人民公社。
1961年9月从临安公社分建上甘公社，属玲珑区。
1984年4月改上甘公社为上甘乡。
2001年8月撤销上甘乡建制，设立上甘街道。
2007年12月村级规模调整，锦城街道市坞村、兰锦村，玲珑街道卦畈村划归锦南街道管辖。
2008年1月更名锦南街道。
2015年，设立锦溪社区。
2017年7月，国务院批准临安撤市设区，锦南街道属临安区。
2018年撤村建居，撤销兰锦村、卦畈村，建立兰锦社区、卦畈社区。