明清时期属君子乡齐贤里八都阳字庄。
民国三十六年（1947）属崇正乡3、4保，1950年为三溪乡3、4村和淳安县三源乡吴家村，1956年与天井坞、王家合建崇正乡三溪高级社，1959年称龙绕管理区三溪生产队和淳安县东亭管理区吴家生产队，1961年析置三溪大队和新吴大队，属龙绕公社，1983年改称龙绕乡三溪和新吴村委会。
2005年11月3日行政区调整，经省人民政府批准龙绕乡并入球川镇，称球川镇三溪、新吴村，2013年村规模调整三溪与新吴2村合并称三溪村。