明清时期属敷教乡石塘里廿九都垂字庄。
民国廿九年（1940）为敷教乡1、2、3保，三十六年(1947)为1、2保，1950年为溪口区阁底乡1、2、3村，1956年与陈家墩、下阁、苗山头合建新建高级社，1959年称阁底、苗山头生产队，属阁底管理区，1961年析置上阁、下阁、苗山头、大塘坞大队，属阁底公社，1983年改称上阁、下阁、苗山头村委会，属阁底乡，2005年11月3日行政区调整，经省人民政府批准阁底乡并入青石镇，称青石镇上阁、下阁、苗山头村，2013年村规模调整上阁、下阁、苗山头3村合并更名为阁底村。