1949年属三港乡；同年7月撤乡建区属递铺区，称余墩村；1950年春属双港乡；1956年2月属双建乡；1956年冬，由晨光、余一、余丰三个初级社全合建和平高级社；1958年9月属递铺公社双港管理区，称和平生产队；1961年8月属双建公社，称和平大队；1981年3月，更名为余墩大队；1981年11月改称凤凰山公社余墩大队；1984年1月称凤凰山乡余墩村。
1995年并乡扩镇时划入递铺镇，仍称余墩村，2001年村改居为余墩社区。
2014年属昌硕街道。