元代属丽江军民府宝山州。
明成化二十三年（1487年），为丽江木氏土司占领，派木瓜统领军政大权。
清康熙四十八年（1709年），中甸自行管理后，上齐腊马尼嘎阁、下齐三坝洛吉河统归江边境神翁管理。
1913年，厅改县，改江边境神翁为江边境千总，三坝仍属江边千总，设把总一名管理。
1938年，推行保甲制，江边境改为第三区，三坝为第四乡。
1950年5月，初设三坝办事处。
1950年6月，设三坝乡。
1958年，成立三坝公社。
1962年，改三坝区。
1968年，成立三坝公社革命委员会。
1977年，划出洛吉和安南九龙与大中甸尼汝合并建立洛吉公社。
1984年，改为三坝区。
1988年，改三坝乡，乡改行政村。
1989年，改三坝纳西族乡。