清移民61户在此地屯垦，故得名“六十一户”。
清光绪十二年（1886），迪化建县时简称“六十户”。
1952年，在米泉梧桐窝子（现五家渠一零二团场）成立的火星集体农庄，因洪水于1953年搬迁六十户乡。
1958年5月，划归昌吉县，为头屯河人民公社火星生产大队。
1960年1月，仍划归乌鲁木齐县，为安宁渠公社火星大队。
“文化大革命”期间，更名为星火大队。
1975年冬，分为星火、六十户、八段3个生产大队。
1983年6月，更名为六十户乡，下设星火、三宫梁、大梁、八段、哈族新6个行政村，19个村民小组。
2011年3月6日，六十户乡人民政府划归高新区（新市区）管辖，沿用至今。