民国时期，属双河乡第3保。
建国后，1951年建政为双河乡第3村。
1955年，建社为双河乡鲜花社。
1958年，为双河公社3管理区。
1962年，为双河公社3大队。
1967年，为齐心公社3大队。
1972年，仍为齐心公社3大队。
1981年，地名普查命名为金堂公双店大队。
1984年，为双流乡双店村。
1985年，为双流镇双店村。
1992年，撤区并乡建镇时，仍为双流镇双店村。
2020年，村级建制调整，撤销瓦店村和双店村，合并设立双店村（营府函〔2020〕72号）。