民国二十四年（1935年），设竹根镇，属犍为县第四区。
1950年8月，属犍为县第八区。
1951年10月，属五通桥市。
1951年11月，属五通桥市第一区。
1955年1月，竹根镇改区级镇。
1956年，五通、竹根2镇合并为桥滩镇，设竹根乡，辖原第一联乡和第六联乡的联盟小乡。
1958年10月，乡改公社，新华、幸福、顺江大队划归果蔬农场。
1962年，撤桥滩镇，析置五通、竹根2镇和竹根公社。
1984年4月，公社改乡。
1985年2月，属乐山市五通桥区（县级）。
1986年9月，五通镇改街道。
1987年，竹根乡并人竹根镇。
1992年9月，五通街道并入竹根镇。
2001年9月，增设7个居民委员会，171个居民小组。
2019年12月13日，撤销杨柳镇，将其所属行政区域划归竹根镇管辖。