1958年8月，我国全面开展人民公社化运动；同年9月，设立凤凰包生产大队管理委员会，简称凤凰包管委会，又称二大队。
1968年9月，更名为凤凰包大队革命委员会。
1981年6月，复名凤凰包生产大队管理委员会。
1984年4月，我国实行政社分设，撤销凤凰包生产大队管理委员会，设立凤凰包村村民委员会，简称凤凰包村村委会。
1993年以前归达县地区巴中县管辖，1993年7月5日，设立巴中地区，巴中撤县建市，属巴中市下八庙乡管辖。
1993年8月31日，撤乡设镇，属巴中市下八庙镇管辖。
2000年6月14日，设巴州区，属巴中市巴州区下八庙镇管辖。
2006年，黄桷树社区成立时，划出1组。
2013年1月18日，设恩阳区，属巴中市恩阳区下八庙镇管辖。
2018年1月，经恩阳区人民政府同意村改居，由凤凰包村改为凤凰包社区，沿用至今。