明属清沿明置，明嘉靖二十七年（1548年）《乐平县志》记载，三都乡隶属于文苑乡郭庄都和石马都，清乾隆十八年（1753年）《乐平县志》记述，全县6都210村，三都乡隶属于乐平文苑乡郭庄都。
民国初年属乐平沾城镇，驻西大街。
1914年，属昔阳沾城镇。
1917年，山西实行“村本政治”，三都乡为杜庄二区。
三都公社共19个生产大队7个自然村。
1918年，实行区村制，全县分4个区，属一区。
1938年5月，属昔东县。
1945年9月，全县分14个区，属昔阳五区，驻西峪。
1946年6月，调整为8个区，分属二区、三区，其中二区驻杜庄、三区驻赵壁。
1949年-1952年属二区管辖，驻地麻汇。
1953年-1955年属三都乡管辖。
1956年-1957年属路家峪乡管辖，驻路家峪。
1958年-1960年属杜庄公社管辖，驻地杜庄。
1961年-1983年属三都公社管辖，驻三都。
1984年属三都乡管辖，驻三都。
2001年3月，撤销小嘴龙底、米家园、花峪、山掌、井庄5个村民委员会。
年末，辖14个村民委员会。
由三都乡管辖至今。