1961年设立南沟生产大队；1984年撤销南沟生产大队，设立南沟村村民委员会。
1949年属附城区的一个行政村，1950至1952年属附城区现岭行政村的一个自然村，1953至1955年属三区南沟乡的一个自然村，1956年属附城基点偏桥底乡的一个自然村，1957年属附城基点积善乡的一个自然村，1958至1960年为西河底红旗公社南沟管理区，1961至1983年为西河底人民公社南沟生产大队，1984至2000年为西河底乡南沟村村民委员会，2001年撤乡改镇至今为西河底镇南沟村村民委员会。