1961年设立马庄生产大队；1984年撤销马庄生产大队，设立马庄村村民委员会。
1949至1952年属附城区的一个行政村，1953至1955年为三区马庄乡的一个自然村，1956年为附城基点万章乡的一个自然村，1957年为附城基点现岭乡的一个自然村，1958至1960年为西河底红旗公社马庄管理区，1961至1983年为西河底人民公社马庄生产大队，1984至2000年为西河底乡马庄村村民委员会，2001年撤乡改镇至今为西河底镇马庄村村民委员会。