1958年该村隶属于新华公社；1962年组建时，北巨大队以大队区域内北巨村村名而得名，隶属长留公社；1968年文革中改为长留公社北巨大队革命委员会；1984年，政社分设，北巨大队分为北巨村村民委员会和长安村村民委员会，隶属长留乡；2000年，北巨村村委会与长安村村委会合并，沿用北巨村村民委员会；2001年，撤乡并镇，长留乡合并到城关镇，因而北巨村村民委员会隶属于城关镇；2015年，城关镇撤销，改制为城关街道，北巨村村民委员会隶属城关街道沿用至今。