1958年公社化时,属灯塔公社的一部分;1959年合县并社时属阳郭公社三官庙管区,管区因驻三官庙而命名;1962年行政区划调整时,在原管区的基础上被命名为三官庙公社;1960年文革中被改为红岭公社;1970年恢复三官庙公社之名。
1984年撤销公社、大队、生产队、实行乡、村建制,隶属于三官庙乡,2001将三官庙乡并入大王乡,2011年将大王乡并入阳郭镇,2016年三官庙村和姚湾村合并为三官庙村。
现隶属于阳郭镇,沿用至今。