王爷府镇自清代至民国年间，一直为喀喇沁旗政治文化中心。
1946年至1948年初是喀喇沁右旗政府和喀喇沁右旗建西县联合政府驻地，1948年春联合政府迁往公爷府后，此地属第一区。
1949年属喀喇沁旗第一区，1958年以驻地村命名为王爷府公社，1967年更名为那尔村公社，1982年恢复原名，1984年人民公社改为乡镇建制，一分为三划为王爷府镇、上瓦房乡和大西沟乡。
1998年秋上瓦房乡和大西沟乡并入王爷府镇，2006年四十家子乡除桥头湾子村、扁担沟村以外部分并入王爷府镇。
隶属喀喇沁旗。