清属金州厅旅安社。
沙俄侵占时,属关东州旅顺行政区。
日本侵略者侵占时期,属关东州厅旅顺民政署水师营会。
民国三十五年(1946年),原水师营会改为中心区,属旅顺市。
1949年,中心区公所改中心区人民政府,属旅顺市。
1951年,中心区人民政府改名第五区人民政府,属旅顺市。
1954年10月,第五区人民政府又改为中心区公所,属旅顺市。
1956年4月,撤区成立水师营、龙头2乡。
1958年9月,乡改社,成立水师营公社。
1960年1月,所辖的原英歌石乡分出,并入大连市奶牛场。
1961年,原龙头乡从水师营公社中划出,成立龙头公社。
1983年,社改乡,成立水师营乡,属旅顺口区。
1985年,乡改镇,成立水师营镇,属旅顺口区。
1997年,旅顺口区区划调整,原沈家行政村并入火石岭行政村,原东沟行政村、三里桥行政村并入小南行政村。
1998年10月20日,镇改街,成立水师营街道。