四甲镇成陆距今1500年历史，元代前后盐业兴旺，古为布州场，“上多流人、煮盐为业”。
清乾隆元年（1736），余中场并入余西场。
乾隆初年（1736），通源镇商人建议于四甲开坝。
四甲坝开成后，沟通南北水运交通，镇、扬、宁、芜外地商人纷纷来此租屋设铺，本地商人亦纷纷开设酒店、茶馆等服务业。
四甲坝就此得名。
民国时期，先后隶属南通县余中乡、十二区、益余区、第十区。
1942年解放区划为东南行署领导，为富余区。
解放后四甲划归海门，称四甲乡人民政府。
1958年10月四甲乡改建为四甲人民公社。
1963年2月四甲街道从四甲人民公社划出另建四甲镇。
1965年2月，撤销镇建置，仍并入四甲人民公社。
1983年5月，四甲人民公社改称四甲乡。
1986年10月撤乡建四甲镇。
2000年4月，撤销国强镇，并入四甲镇，2012年12月，苏政复〔2012〕103号，将货隆镇并入四甲镇。