1949年—1956年，该区域属民主乡。
1956年—1957年，属五里墩街道。
1957年—1960年，随着五里墩街道合并至车站街道，属车站街道。
1960年—1961年，属汉阳人民公社车站分社。
后撤销分社，1961年—1980年，属车站街道（于1973年改名翠微街道），1980年，翠微街道一分为二，重属五里墩街道。
2000年，原五里新村居民委员会、五里二村居民委员会、张家上湾居民委员会北侧部分合并成为五琴里社区居民委员会。
五里三村虽地处该辖区，但为五墨里社区冷冻机厂宿舍楼，原归属于五墨里社区居民委员会管辖，2005年划入五琴里社区居民委员会。
2012年，由原五里一村居民委员会与五里后村居民委员会合并成立的五新里社区居民委员会又因武汉轨道交通四号线的建设拆迁并入五琴里社区居民委员会。