据《谷城县志》记载，太平店镇和谷城县的庙滩、茨河、黄畈一带古称山都，战国时期为南阳之赤乡，后建山都国。
秦置山都县属南阳郡，治所在和城（今太平店）。
两晋时，山都县初属南阳郡，后属襄阳郡。
南北朝刘宋时期属雍州新野郡，南齐曾改属宁蛮府义安郡。
梁（南北朝时的一小国）为山都县，属襄阳郡。
北周省山都入安养县，属河南郡。
隋初，省安养将原山都辖地划入筑阳（谷城）。
隋文帝开皇七年（587），省筑阳入义成。
开皇十八年（598）改义成县为谷城县。
炀帝大业初，省襄州、谷城属荆州襄阳郡。
唐、宋、元时，太平店一直在谷城、光化、襄阳三县之间来回辖属，直至清代属谷城县。
民国时期本地仍属谷城县管辖，1948年7月谷城全境解放。
从此，以汉水为界，太平店划归襄阳县。
1949年太平店划归襄阳县，1951年太平镇县辖镇；1953年太平店为区辖镇三区；1958年建立人民公社，实行政社合一；1964年朱坡区改称太平区；1975年1月，撤区，原区改称人民公社；太平人民公社辖朱坡、徐堤、小樊、太平、大冲5个管理区。
1981年7月太平公社改称太平店公社，设辖镇；1984年3月，设区建乡。
原公社改称区或县辖镇，太平店镇辖5个乡。
1986年设太平店县辖镇。
1987年9月，太平店镇一分为二，分为朱坡乡和太平店镇。
2001年3月，襄阳县撤区并乡，朱坡乡并入太平店镇，镇政府驻太平店。
8月，太平店镇划归樊城区管辖。