六角亭街道上古时期属廪君国。
春秋属巴子国；战国属楚巫郡；秦属黔中郡；汉属南郡；三国与晋属沙渠县；后周属施州清江郡；隋、唐、宋属清江县；明属施州卫；清雍正六年（1728）属施县、七年（1729）属恩施县、雍正十三年（1735）属施南府恩施县市郭里。
民国先后属湖北省恩施县，荆南道、施鹤道、鄂西行政区、第十行政督察区、第七行政督察区恩施县（1940年设城厢镇，今辖区为其一部分）。
1949年11月6日恩施解放，7日成立恩施县人民政府，设城乡区（今辖区为其一部分）；1952年改名城关镇，辖八乡（五峰山、鸭子塘、七里坪、飞机村、高桥坝、头道水、谭家坝、东方红）七街（其中一街为舞阳坝，七街为土桥坝，二至六街为今办所属）。
1958年9月城关镇与五峰山乡合并，成立灯塔人民公社，原八乡七街改为11个管理区，城市部分划分3个管理区，现在的胜利街、小十街、解放路、和平街、城乡街5条街道属二、三管理区；1960年6月在五峰山成立灯塔区，城区成立城市人民公社，辖13个管理区，今六角亭街道办事处范围内有八一、六角、公园、大桥、大十5个管理区；1961年恢复城关镇；1968年成立城关镇革命委员会，取代城关镇政府；1981年1月取消革委会，恢复城关镇，同年9月改为施南镇。
1982年成立恩施市，恩施县与恩施市分治，5月1日成立恩施市六角亭街道办事处，驻解放路103号，下辖胜利街（原二街）、小十街（原三街）、解放路（原四街）、和平街（原五街）、城乡街（原六街）5个居民委员会。
1984年恩施县并入恩施市，辖区原样保留；1992年10月，小渡船街道办事处所辖书院、月亮岩两村，红庙经济开发区所辖高桥坝、头道水两乡划入六角亭街道办事处，共辖5个居委会、两个乡政府（13个村委会）。
2001年12月，5个居委会合并为六角亭、胜利街、城乡街3个社区居民委员会。
2002年10月，撤销高桥坝、头道水两乡，设高桥坝、松树坪、头道水、谭家坝4个村民委员会，书院村改为书院社区居民委员会。
2021年12月，松树坪村实施村改社区，松树坪村改为松树坪社区。
2022年1月，六角亭街道对辖区各村（社区）社区管辖范围优化调整，新设立西湖社区。
辖解放路、城乡街、胜利街、书院、松树坪、西湖6个社区，高桥坝、谭家坝、头道水3个村。