蔡家沟：清朝年间，有人来此定居而逐渐形成村庄院落。
1949年为三区红庙乡六分会，1954年为三区红庙乡解放六社，1958年为三区芝河公社蔡家沟大队，1975年划归嚣川管辖为嚣川公社蔡家沟大队，1984年为嚣川区芝河乡蔡家沟村。
1987年为嚣川乡芝河管理区蔡家沟村。
1993为均县镇蔡家沟村。
方沟：1949年为三区红庙乡一分会，1954年为三区红庙乡解放一社，1958年为芝河公社方沟大队，1975年划归嚣川管辖为嚣川公社方沟大队，1984年为嚣川区芝河乡方沟村，1987年为嚣川区芝河管理区方沟村，1993年为均县镇方沟村。
2002年因移民外迁及机构改革蔡家沟村与方沟村合并为蔡方沟村。