扎龙屯形成于清康熙朝前期，其后陆续辟建哈拉乌苏、翁海、塘土岗子、吐木柯、赵凯、大吹巴等屯，属齐齐哈尔副都统管辖。
清末民初,先后隶属龙江府和龙江县管辖。
东北沦陷后,初隶小阿拉街乡保，后改隶小阿拉村。
1945年“九三”抗日战争胜利后，1946年6月，划归龙东县管辖。
1948年3月，撤销龙东县，并入龙江县。
1951年7月，划归齐齐哈尔市，隶属农村区管辖。
1954年10月隶榆树屯区。
1956年5月，并村划乡,设置哈拉乌苏乡。
1958年12月，划归边屯管理区。
1965年改隶边屯公社。
1978年从边屯公社划出，成立扎龙公社。
1984年1月,改为扎龙乡。
2012年改置镇，名称沿用至今。