民国三十六年（1947年），马厂镇境域分属流河区、刘世印屯区。
1953年3月，分设马厂、王维屯、孙官屯、旧张屯、王胜武屯、杨官店、陈缺屯、伊庄子、刘世印屯9个乡，分属流河区和大杜庄区。
1957年，9乡合并成王维屯、陈缺屯2乡。
1958年9月，2乡合并建庆丰公社。
1958年11月，属静海县。
1961年6月，复属青县，分为马厂、陈缺屯2个公社。
1984年3月，分别改为马厂乡、陈缺屯乡。
1995年12月，陈缺屯乡、马厂乡合并为马厂镇。