解放前为北宁乡第五堡；1950年为北宁乡人民政府第五村；1953年为高武乡第五村；1956年为高武乡马乃屯高级社；1958年为潘家庄公社高武管理区马乃屯大队；1962年为高武公社马乃屯大队；1992年为下山镇马乃屯村；地名普查和资料更新调查后，该村寨隶属于下山镇；2007年9月，根据《兴仁县人民政府关于对下山镇村级整合实施方案的批复》仁府函[2007]84号文件，同意将原来马乃屯村、杨家庄村整合为马乃屯村，办公地点设在马乃屯村的村民委员会办公室。