明朝洪武年间（1368—1398年），设马蚌甲，隶属安隆长官司。
清康熙年间（1622—1722年），归属古障甲。
民国十八年（1929年），设马蚌乡，隶属西隆县；民国二十四年（1935年），划归西林县。
1951年8月，随西林县并入隆林各族自治县，称第十一区。
1958年称，团结公社。
1963年，后复称马蚌区、马蚌公社。
1984年，改称马蚌乡。
1996年，村公所改称村民委员会。
2006年，由原八大河乡并入马蚌乡，乡政府驻地设在八大河。
2016年1月，经广西壮族自治区人民政府同意，马蚌乡由乡建制改为镇建制。