清以前属福建诏安县云澳区，称荖园乡。
1914年归属广东省南澳县第三区，称荖园乡。
1952年称第二区青澳乡荖园村。
合作化称荖园生产大队，1969年称荖园村革命委员会，1980年恢复生产大队。
1986年属云澳镇，称荖园村委员会。
1989年属云澳镇，称荖园管理区，1998年属云澳镇称荖园村村委会，2004年调整村委规模与东澳村合并为东园村委员会，撤销荖园村委会。
2017年撤销东园村民委员会，荖园村与东澳两村再次分设，成立荖园村村民委员会，并沿用至今。