明万历三年（1575年）设协守漳、潮等处专驻南澳副总兵。
翌年在隆澳筑城，与深澳、云澳互为犄角。
镇境东部古称隆澳，名源于前江湾畔隆眼砂澳。
清《南澳志》载：“隆澳南北皆面海，南为大海，北为内海，南称前江，北称后汐，澳人读汐若宅，故亦作后宅。”民国三年（1914年），南澳分设三区，隆澳为第二区。
民国二十二年（1933年），由广东民政厅训令，准南澳县设隆澳第二行署。
从此，南澳县城从深澳迁移到隆澳（隆澳即今后宅镇）。
1954年5月，南澳划归粤东行政公署管辖，设置后宅镇。
1961年3月，改设为后宅公社。
1984年2月，经广东省政府批准，后宅公社改设为后宅镇。