清朝时期，属旧城里。
民国二年（1913年），划归后旧城。
民国二十四年（1935年），为终南乡。
1950年7月，为磨坝、改石乡，属透防区。
1952年，增设东村乡。
1955年10月，东村乡并入改石乡。
1958年3月，改石、磨坝乡合并为桔柑乡；10月组建为桔柑公社；同年11月，并入透防公社。
1961年6月，从透防、三河公社划出部分大队复设桔柑公社。
1983年12月，复属桔柑乡。
1986年6月，桔柑乡析置磨坝藏族乡。