1949年文县解放，1951年全县调整为6区46乡，属兴文区旧寨乡辖。
1953年6月全县调整为9区70乡，仍属兴文区旧寨乡辖。
1955年10月合并区、乡机构，旧寨乡并入铁楼乡，今石门沟村随之并入，属兴文区铁楼乡辖。
1958年12月成立城关公社，为城关公社石门沟大队。
1961年公社划小，为铁楼公社石门沟大队。
1981年铁楼公社改为铁楼藏族公社，属铁楼藏族公社辖。
1983年10月铁楼藏族公社改为铁楼藏族乡，属铁楼藏族乡辖。
1984年4月石门沟大队改为石门沟村，村下建合作社。
1986年设立石门沟村村民委员会，所属合作社改称村民小组。