北宋时，王店设为冶坊堡、寨。
金升冶坊寨为县。
元初并冶坊县入清水县。
本村有“冶坊城”遗址，村东山塬上有“东岳泰山庙”遗址，蒲家台子（庄）出土宋“仪制令”碑，历史文化悠久。
1949年前隶属于上邽镇。
1949年为冶坊乡王店村。
1958年为黄门公社王店大队。
1984年为黄门乡王店村委会，辖王店、宁家庄、蒲家台子三个自然村。
民国时期为保甲制，1949年初为王店村人民代表大会，1955年至1958年为王店农业合作社，1958年至1980年为王店生产大队，1983年至今为王店村民委员会。