西汉至十六国“五凉”时期，柏树镇境域属武威郡姑臧县。
北魏至隋初，属武威郡林中县。
唐宋年间，分归姑臧县和神鸟县。
元时，属永昌路西凉州。
明清时期，先后归凉州卫和武威县。
民国元年（1912年）后，属武威县金塔乡。
1949年9月后，属金塔区。
1952年7月，属第二区（金塔）。
1956年1月，为柏树乡。
1958年10月，中心、柏树乡合并成立金塔公社。
1962年，成立柏树公社。
1983年7月，设柏树乡。
2018年3月，撤乡，设柏树镇。