金溪河谷早在青铜时代，就有人类定居。
五代后唐建县时，择陈塘洋为县治所在，后迂城关。
宋代属安东乡金溪里。
明代置都，现金涵乡地域为安东乡陵山里四都。
清代沿之，统村十六个。
民国二十七年（1938年）属宁德县第一区。
民国三十二年，分为宁德县濂坑乡及蕉城镇金涵保地。
解放初，1952年属二区（区公所驻漳湾），1961年属宁德县城郊区。
1966年7月撤区设金涵人民公社，1984年10月，撤销人民公社建制，建立金涵乡，1995年，改金涵乡为金涵畲族乡。