1949年前属大河乡第八保的一部分。
1951年民主建政时为第八村的一部分，属大河乡。
1953年3月，由大河析置木楠乡时，第八村随划，并分置为两个村，清水村即以境内清水溪命名。
1956年1月，木楠废入小河乡，清水村随隶。
1958年时，改称清水管区，属小河区队，1961年又改称清水大队。
属小河公社。
1981年地名普查时，更小河名水寒，复又更名为木楠公社，大队仍属，1984年1月，清水大队改称清水村，同时设立清水村村民委员会，隶木楠乡。
2001年，新建保家镇，木楠乡隶属，村随属。
2003年12月组建清水村，含原过路村、清水村、木洞村，名称沿用至今。