1934年设保，起垅村的大部分村民属马桥保；1950年改属马桥行政村；1952年4月改名起垅村，属马桥乡；1956年4月跳头、马东等生产队属马桥高级农业社；1958年10月，属于大公圩公社马桥大队；1962年3月改名为起垅大队，划属石桥人民公社；1969年3月，起垅、石桥两公社合并为石桥人民公社起垅大队，属起垅公社管辖。
1984年体改，废公社、大队体制，成立乡、行政村组织，原起垅大队改为起垅行政村，属石桥人民政府。
2005年10月，起垅村和新建村合并为起垅村村民委员会，属石桥镇人民政府。